Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms