Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms