Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL1Q08397 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms