Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms