Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
CD164Q04900 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CD164Q04900 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms