Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms