Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms