Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms