Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms