Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms