Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms