Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms