Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms