Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms