Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMF1P82094 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMF1P82094 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMF1P82094 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TMF1P82094 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TMF1P82094 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMF1P82094 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMF1P82094 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMF1P82094 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMF1P82094 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMF1P82094 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMF1P82094 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMF1P82094 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMF1P82094 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMF1P82094 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TMF1P82094 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMF1P82094 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMF1P82094 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMF1P82094 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TMF1P82094 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMF1P82094 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMF1P82094 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMF1P82094 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMF1P82094 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMF1P82094 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMF1P82094 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMF1P82094 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMF1P82094 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMF1P82094 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TMF1P82094 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMF1P82094 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMF1P82094 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMF1P82094 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMF1P82094 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMF1P82094 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMF1P82094 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMF1P82094 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TMF1P82094 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMF1P82094 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMF1P82094 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMF1P82094 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TMF1P82094 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TMF1P82094 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMF1P82094 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMF1P82094 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMF1P82094 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TMF1P82094 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMF1P82094 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMF1P82094 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMF1P82094 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMF1P82094 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMF1P82094 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMF1P82094 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMF1P82094 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMF1P82094 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TMF1P82094 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMF1P82094 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMF1P82094 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMF1P82094 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMF1P82094 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMF1P82094 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMF1P82094 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMF1P82094 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMF1P82094 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMF1P82094 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMF1P82094 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMF1P82094 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMF1P82094 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMF1P82094 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMF1P82094 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMF1P82094 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMF1P82094 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMF1P82094 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMF1P82094 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMF1P82094 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMF1P82094 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMF1P82094 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMF1P82094 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMF1P82094 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMF1P82094 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMF1P82094 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMF1P82094 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMF1P82094 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMF1P82094 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMF1P82094 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMF1P82094 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMF1P82094 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMF1P82094 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMF1P82094 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMF1P82094 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMF1P82094 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMF1P82094 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMF1P82094 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMF1P82094 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TMF1P82094 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMF1P82094 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMF1P82094 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMF1P82094 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMF1P82094 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMF1P82094 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms