Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms