Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX3P78415 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX3P78415 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX3P78415 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX3P78415 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX3P78415 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX3P78415 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX3P78415 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX3P78415 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX3P78415 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX3P78415 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX3P78415 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX3P78415 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX3P78415 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX3P78415 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX3P78415 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX3P78415 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX3P78415 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX3P78415 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX3P78415 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX3P78415 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX3P78415 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX3P78415 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX3P78415 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX3P78415 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX3P78415 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX3P78415 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX3P78415 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX3P78415 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX3P78415 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRX3P78415 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRX3P78415 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRX3P78415 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRX3P78415 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRX3P78415 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRX3P78415 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRX3P78415 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX3P78415 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX3P78415 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX3P78415 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX3P78415 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX3P78415 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX3P78415 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX3P78415 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX3P78415 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX3P78415 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX3P78415 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX3P78415 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX3P78415 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX3P78415 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX3P78415 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX3P78415 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms