Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFM1P61960 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFM1P61960 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFM1P61960 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFM1P61960 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFM1P61960 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFM1P61960 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFM1P61960 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFM1P61960 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFM1P61960 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFM1P61960 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFM1P61960 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UFM1P61960 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UFM1P61960 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UFM1P61960 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UFM1P61960 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UFM1P61960 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UFM1P61960 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UFM1P61960 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UFM1P61960 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UFM1P61960 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UFM1P61960 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UFM1P61960 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UFM1P61960 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UFM1P61960 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UFM1P61960 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UFM1P61960 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UFM1P61960 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFM1P61960 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UFM1P61960 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFM1P61960 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFM1P61960 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFM1P61960 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFM1P61960 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFM1P61960 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFM1P61960 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms