Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EEFSECP57772 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms