Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF3P57682 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF3P57682 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF3P57682 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF3P57682 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF3P57682 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF3P57682 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF3P57682 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF3P57682 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF3P57682 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF3P57682 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF3P57682 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF3P57682 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms