Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D1P54289 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms