Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUCLG1P53597 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUCLG1P53597 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUCLG1P53597 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUCLG1P53597 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUCLG1P53597 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SUCLG1P53597 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SUCLG1P53597 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUCLG1P53597 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms