Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOSBP53539 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOSBP53539 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOSBP53539 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOSBP53539 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOSBP53539 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOSBP53539 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOSBP53539 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOSBP53539 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOSBP53539 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOSBP53539 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOSBP53539 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOSBP53539 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOSBP53539 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOSBP53539 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOSBP53539 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOSBP53539 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOSBP53539 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOSBP53539 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOSBP53539 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FOSBP53539 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSBP53539 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSBP53539 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSBP53539 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSBP53539 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSBP53539 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSBP53539 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSBP53539 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSBP53539 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSBP53539 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSBP53539 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSBP53539 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSBP53539 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSBP53539 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSBP53539 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSBP53539 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSBP53539 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSBP53539 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSBP53539 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSBP53539 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSBP53539 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSBP53539 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSBP53539 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSBP53539 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSBP53539 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSBP53539 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSBP53539 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSBP53539 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSBP53539 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSBP53539 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSBP53539 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSBP53539 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSBP53539 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSBP53539 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSBP53539 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSBP53539 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSBP53539 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSBP53539 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSBP53539 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSBP53539 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSBP53539 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSBP53539 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSBP53539 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSBP53539 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSBP53539 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSBP53539 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSBP53539 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSBP53539 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSBP53539 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSBP53539 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSBP53539 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms