Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms