Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms