Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX5P48382 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX5P48382 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX5P48382 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX5P48382 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX5P48382 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX5P48382 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX5P48382 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX5P48382 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX5P48382 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX5P48382 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX5P48382 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX5P48382 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX5P48382 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX5P48382 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX5P48382 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX5P48382 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX5P48382 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX5P48382 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX5P48382 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX5P48382 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX5P48382 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFX5P48382 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFX5P48382 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFX5P48382 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX5P48382 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX5P48382 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX5P48382 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX5P48382 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX5P48382 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX5P48382 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX5P48382 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX5P48382 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX5P48382 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX5P48382 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX5P48382 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX5P48382 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX5P48382 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX5P48382 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX5P48382 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX5P48382 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX5P48382 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX5P48382 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX5P48382 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX5P48382 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX5P48382 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX5P48382 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX5P48382 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX5P48382 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX5P48382 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX5P48382 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX5P48382 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX5P48382 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX5P48382 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX5P48382 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX5P48382 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX5P48382 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX5P48382 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX5P48382 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX5P48382 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX5P48382 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX5P48382 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX5P48382 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX5P48382 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX5P48382 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX5P48382 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX5P48382 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX5P48382 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX5P48382 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX5P48382 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX5P48382 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX5P48382 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX5P48382 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX5P48382 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX5P48382 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX5P48382 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX5P48382 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX5P48382 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX5P48382 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms