Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNPDA1P46926 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNPDA1P46926 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms