Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMPOP42166 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMPOP42166 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMPOP42166 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMPOP42166 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMPOP42166 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPOP42166 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPOP42166 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPOP42166 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPOP42166 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPOP42166 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPOP42166 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPOP42166 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPOP42166 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPOP42166 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPOP42166 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPOP42166 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPOP42166 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPOP42166 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPOP42166 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPOP42166 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPOP42166 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPOP42166 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPOP42166 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPOP42166 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPOP42166 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPOP42166 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPOP42166 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPOP42166 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPOP42166 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPOP42166 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPOP42166 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPOP42166 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPOP42166 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPOP42166 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPOP42166 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPOP42166 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPOP42166 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPOP42166 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPOP42166 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPOP42166 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPOP42166 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPOP42166 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPOP42166 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPOP42166 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPOP42166 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPOP42166 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPOP42166 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPOP42166 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPOP42166 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPOP42166 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPOP42166 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPOP42166 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPOP42166 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPOP42166 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPOP42166 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPOP42166 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPOP42166 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPOP42166 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPOP42166 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPOP42166 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPOP42166 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPOP42166 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPOP42166 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPOP42166 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms