Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms