Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA3P32297 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms