Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA5P30532 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms