Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC27P30260 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC27P30260 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC27P30260 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC27P30260 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC27P30260 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC27P30260 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC27P30260 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC27P30260 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC27P30260 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC27P30260 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC27P30260 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC27P30260 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC27P30260 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC27P30260 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC27P30260 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC27P30260 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC27P30260 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC27P30260 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC27P30260 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC27P30260 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC27P30260 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC27P30260 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC27P30260 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC27P30260 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC27P30260 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC27P30260 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC27P30260 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC27P30260 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC27P30260 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC27P30260 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC27P30260 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC27P30260 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms