Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD34P28906 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD34P28906 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD34P28906 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD34P28906 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms