Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD27P26842 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD27P26842 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD27P26842 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD27P26842 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD27P26842 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD27P26842 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD27P26842 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD27P26842 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD27P26842 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD27P26842 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD27P26842 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD27P26842 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD27P26842 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD27P26842 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD27P26842 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD27P26842 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD27P26842 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD27P26842 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD27P26842 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD27P26842 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD27P26842 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD27P26842 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD27P26842 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD27P26842 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD27P26842 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD27P26842 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD27P26842 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD27P26842 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD27P26842 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD27P26842 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD27P26842 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD27P26842 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD27P26842 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD27P26842 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD27P26842 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CD27P26842 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD27P26842 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD27P26842 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD27P26842 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD27P26842 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD27P26842 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD27P26842 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD27P26842 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD27P26842 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD27P26842 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD27P26842 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD27P26842 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CD27P26842 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms