Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms