Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms