Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms