Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

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Length 2,839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NF1P21359 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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NF1P21359 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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NF1P21359 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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NF1P21359 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NF1P21359 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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NF1P21359 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NF1P21359 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NF1P21359 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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NF1P21359 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NF1P21359 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NF1P21359 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NF1P21359 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NF1P21359 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NF1P21359 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NF1P21359 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NF1P21359 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NF1P21359 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NF1P21359 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NF1P21359 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NF1P21359 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NF1P21359 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NF1P21359 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NF1P21359 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NF1P21359 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NF1P21359 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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