Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NTF3P20783 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NTF3P20783 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms