Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB1P20618 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms