Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSP20132 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSP20132 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSP20132 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSP20132 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSP20132 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSP20132 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSP20132 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSP20132 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSP20132 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSP20132 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSP20132 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSP20132 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSP20132 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSP20132 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSP20132 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSP20132 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSP20132 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSP20132 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSP20132 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDSP20132 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDSP20132 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDSP20132 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDSP20132 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDSP20132 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDSP20132 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDSP20132 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDSP20132 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDSP20132 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDSP20132 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDSP20132 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDSP20132 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDSP20132 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDSP20132 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDSP20132 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSP20132 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SDSP20132 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms