Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms