Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLP19338 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLP19338 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLP19338 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLP19338 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLP19338 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLP19338 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLP19338 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLP19338 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLP19338 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLP19338 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLP19338 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLP19338 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLP19338 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLP19338 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLP19338 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLP19338 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLP19338 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLP19338 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLP19338 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLP19338 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLP19338 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLP19338 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLP19338 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLP19338 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLP19338 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLP19338 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLP19338 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLP19338 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLP19338 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLP19338 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLP19338 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLP19338 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLP19338 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLP19338 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLP19338 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLP19338 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLP19338 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLP19338 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms