Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPI1P17947 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPI1P17947 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPI1P17947 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPI1P17947 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPI1P17947 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPI1P17947 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPI1P17947 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPI1P17947 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPI1P17947 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPI1P17947 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPI1P17947 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPI1P17947 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPI1P17947 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPI1P17947 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPI1P17947 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPI1P17947 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPI1P17947 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPI1P17947 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPI1P17947 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPI1P17947 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPI1P17947 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPI1P17947 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPI1P17947 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPI1P17947 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPI1P17947 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPI1P17947 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPI1P17947 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPI1P17947 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPI1P17947 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPI1P17947 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPI1P17947 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPI1P17947 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPI1P17947 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPI1P17947 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPI1P17947 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPI1P17947 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPI1P17947 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPI1P17947 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPI1P17947 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPI1P17947 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPI1P17947 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPI1P17947 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPI1P17947 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPI1P17947 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPI1P17947 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPI1P17947 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms