Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms