Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2AP11388 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms