Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP1P11387 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP1P11387 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP1P11387 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP1P11387 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP1P11387 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP1P11387 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP1P11387 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP1P11387 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP1P11387 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP1P11387 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP1P11387 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP1P11387 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP1P11387 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP1P11387 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP1P11387 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP1P11387 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP1P11387 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP1P11387 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP1P11387 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP1P11387 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP1P11387 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP1P11387 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TOP1P11387 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TOP1P11387 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TOP1P11387 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP1P11387 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP1P11387 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP1P11387 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP1P11387 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP1P11387 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP1P11387 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP1P11387 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP1P11387 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP1P11387 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP1P11387 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP1P11387 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP1P11387 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP1P11387 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP1P11387 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP1P11387 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP1P11387 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP1P11387 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP1P11387 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP1P11387 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms