Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms