Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms