Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM228BP0C875 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM228BP0C875 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM228BP0C875 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM228BP0C875 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM228BP0C875 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM228BP0C875 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM228BP0C875 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM228BP0C875 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM228BP0C875 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM228BP0C875 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM228BP0C875 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms